RareFold 在 AlphaFold2 架构上引入“氨基酸 token 扩展”策略，使模型能够直接建模 29 种非天然氨基酸的结构特征，并在多项预测任务中优于 AlphaFold3；同时结合 EvoBindRare 框架，实现了含非天然氨基酸线性与环状多肽的从头设计，并通过 SPR 实验获得 μM 级真实结合活性。