LigandMPNN 在 ProteinMPNN 基础上引入配体原子级上下文建模，可同时感知蛋白与小分子、核酸、金属离子的空间关系，在序列设计与侧链构象预测上全面超越 Rosetta 与传统方法，并通过多组结合实验验证其真实功能性。