这里汇总了我对 AI4S、蛋白设计、结构生物学等方向的长期文献解读。
AI4S文献
Science|DrugCLIP:走向基因组级别的小分子筛选
DrugCLIP 通过对比学习将虚拟筛选推进到基因组尺度,实现亿级分子规模的高效筛选,并构建了可直接使用的 GenomeScreenDB 资源。
AI4S文献
ICML 2025|UniMoMo:多肽、小分子与抗体设计的统一生成框架
UniMoMo 提出首个统一建模小分子、肽与抗体结合体的生成框架,通过 Graph of Blocks 表示与几何潜空间扩散模型,实现跨分子类型的高质量生成,在三类任务上全面超越现有专用模型,展示出“通用分子生成模型”的可行性。
AI4S文献
Cell|西湖大学卢培龙团队从头设计出可“感电”的人工离子通道
西湖大学卢培龙团队在 Cell 报道首个完全从零设计、具备电压响应能力的人工离子通道蛋白,在结构、电生理与神经元系统中均获得功能验证,展示了“可感知、可响应”蛋白的可编程设计能力。
AI4S文献
Nature Nanotechnology|从头设计可对 pH 响应的自组装螺旋蛋白丝
Nature Nanotechnology 报道一种完全从头设计的螺旋蛋白丝,可在不同 pH 条件下实现可逆自组装与解聚,并通过 cryo-EM 精确解析其原子结构,展示了蛋白质作为“可编程纳米材料”的巨大潜力。
AI4S文献
从 AlphaFold 到 AlphaProteo:DeepMind 如何从“预测”跨越到“设计”?
DeepMind 推出 AlphaProteo,将能力从结构预测推进到高亲和力蛋白结合物设计,并在 SARS-CoV-2、VEGF-A 等真实体系中实现功能级验证,标志着蛋白设计迈入可直接应用阶段。
AI4S文献
AI生成可复活噬菌体基因组:Evo模型开启生成式基因组学时代
Arc Institute 团队利用基因组语言模型 Evo 首次实现完整噬菌体基因组的生成、合成与复活,标志着 AI 从蛋白质设计迈入生命系统整体设计阶段。
AI4S文献
Nature|DNA 分子构建的神经网络实现监督学习
Nature 报道研究团队首次在试管中构建出可进行监督学习的 DNA 分子神经网络,使分子系统能够自主形成记忆并完成复杂图案分类任务,标志着分子计算从“能算”迈向“能学”。