DrugCLIP 通过对比学习将虚拟筛选推进到基因组尺度，实现亿级分子规模的高效筛选，并构建了可直接使用的 GenomeScreenDB 资源。

西湖大学曹龙兴团队在 Science 报道一种从头设计的“动态蛋白系统”，可在两种构象状态间稳定切换，并通过口服小分子实现对蛋白组装与解体的精准遥控。该系统不仅在体外成立，还在细胞与小鼠体内实现稳定、可逆、低漏启动的功能调控。

Baker 团队提出 RFdiffusion2 框架，从反应所需的关键原子几何出发，直接生成可折叠、可表达、且具备高催化活性的 de novo 金属水解酶。设计酶 ZETA 系列在无需定向进化的情况下即达到 10⁴–10⁵ M⁻¹ s⁻¹ 的催化效率，并通过晶体结构验证其与设计模型高度一致，标志着功能导向蛋白设计范式的成立。